SNP筛查和鉴定——PCR测序法


                       SNP
筛查和鉴定——PCR测序法


简介:
人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)。SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组30亿个碱基中,平均每1000个就有一个SNPSNP作为第三代遗传标记,在复杂疾病的基因定位、关联分析、个体疾病易感性分析与药物基因组学的研究中发挥着愈来愈重要的作用。为适应日益增长的 SNP研究需求,和各类客户的不同需要,威斯腾生物中心利用多套技术方案为不同客户提供量身定做的个性化服务。


 

PCR和测序结合法:

 

特点:

1、适合对短基因片断的SNP筛查

2、通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%

3、威斯腾生物技术中心成熟的DNA测序平台,完善的操作流程和可靠的质量体系,是您成功完成SNPs检测工作的保证。


原理:

将可能的SNP位点进行PCR扩增,结合DNA测序找到SNP位点并确定碱基替换类型.


实验流程:

1、基因组DNA和相关信息获取,设计引物并合成

2PCR扩增目的片段

3PCR产物纯化及电泳检测,测序PCR反应,测序后产物纯化

4、毛细管电泳,以及数据生成和分析


客户需知:

1、准确的基因名称和序列以及详细的SNP位点信息

2、提供样品要:A、血液样品(至少4ml、需加EDTAB、基因组DNA 样品,需-20度保存和运输

3、纯度要求:OD260/2801.6~1.8之间;OD260/2301.8~2.2之间

4、浓度要求( C) :基因组DNA浓度大于100ng/µl

5、单个PCR反应量(M)100ng

6DNA用量需求(µL):PCR反应个数(N* M/ C


结果提供:

1、提供每个PCR产物的琼脂糖凝胶电泳图片

2、提供电子版测序数据及实验流程

3、提供数据分析服务

4、实验数据及实验剩余的样品和引物为客户所有


实验费用:

1、基因组DNA提取费用

2、引物设计及合成费用

3PCR扩增及产物纯化费用

4、测序费用

5、数据分析费用。


【本平台合作项目】

分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIPCO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!

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