ChIP-seq/circRNA测序

ChIP-seq/circRNA测序

ChIP-seq测序

ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

ChIP-seq优势:

用于在全基因组范围中研究蛋白特异结合的DNA片段,组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色体的功能结构。具有“覆盖全,周期快,分析科学”的优势,已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究。

ChIP-seq操作步骤:

1、研究对象的选取;

2、提取DNA样本,DNA量≥20ng;

3、ChIP-seq文库构建;

4、PE150测序(10-20Mb);

5、信息分析,通过对IP下来的合格DNA样本,建库测序,获得高质量reads,根据SCC曲线判断IP效果,通过motif分析判断IP的特异性以及分析的可信性,高效预测相关基因,进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能,组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。

服务周期:

50天

案例分析

案例:雌***受体结合异常与乳腺癌临床试验的相关性研究
雌***受体(ER)可与相关基因结合形成复合体并移位到细胞核结合下游基因激活它们转录,为肿瘤生长助力。在许多乳腺患者体内,就是因为该受体影响了基因的功能,从而引发致癌连锁